Рядом с этим храмом находилась целая систем каналов, в которых жили священные животные, которых в Ком-Омбо особо почитали – крокодилы.
Бог Себек, которому посвящена часть этого храма, представлялся именно в облике крокодила. Он почитался как покровитель изобилия и считался творцом мира.
Теперь в храме хранятся мумии крокодилов, которых извлекли из древнего погребения, устроенного недалеко от храма.